INGÉNIEUR EN TERMINOLOGIE BIOMÉDICALE - H/F

💼 Offre d'emploi

Type de contrat

Contrat à durée déterminée - 12 Mois

Durée de travail

Temps plein

Expérience

Expérience exigée

Salaire

Mensuel de 2985,00 Euros à 4380,00 Euros

Permis demandé

Aucune information

📍 Entreprise

Description de l'offre

Description :


MISSION PRINCIPALE
Au sein de l'équipe projet FReSH, vous aurez pour mission principale de concevoir et de mettre en œuvre les solutions pour assurer l'interopérabilité sémantique des différentes ressources terminologiques du portail FReSH. Vous implémenterez des terminologies de référence pertinentes pour répondre à des besoins du projet et développerez les pipelines de traitements sémantiques.
 
ACTIVITÉS PRINCIPALES
* Analyser les besoins du projet et définir les ressources terminologiques nécessaires pour assurer la cohérence et l'uniformité des métadonnées.
* Spécifier, tester et valider les terminologies servant à harmoniser les métadonnées et construire les vocabulaires contrôlés.
* Collaborer avec le service en charge du Serveur Multi-Terminologique de l'ANS et les équipes de recherche expertes en ingénierie terminologique, en France et à l'International.
* Collaborer avec le prestataire chargé du développement informatique pour intégrer les ressources terminologiques et les standards de métadonnées dans le catalogue.
* Mettre en place les processus semi-automatiques d'indexation des contenus en texte libre en utilisant des vocabulaires contrôlés.
* Concevoir un framework d'alignement des terminologies dans le catalogue ; capitaliser sur les alignements réalisés pour les réutilisations futures.
* Travailler avec des interlocuteurs scientifiques experts de la discipline pour générer et enrichir des correspondances grâce au cadre développé.
* Mettre en oeuvre l'alignement des métadonnées du catalogue avec les référentiels.
* Documenter les décisions techniques prises et les choix de conception relatifs aux ressources terminologiques et aux standards de métadonnées.
* Assurer la veille sur les évolutions des terminologies médicales et des standards d'indexation.
* Agir en tant que porte-parole technique dans son domaine d'expertise.
 
SPÉCIFICITÉ(S) ET ENVIRONNEMENT DU POSTE
*  Participer aux réunions avec les partenaires nationaux et internationaux.



Profil recherché :


CONNAISSANCES
* Expertise approfondie des ressources terminologiques pertinents dans le domaine de la santé humaine (CIM, MeSH, SNOMED).
* Maîtrise des techniques de traitement du langage naturel appliquées au domaine médical.
* Compétences en programmation, notamment en Python ou R, pour l'analyse de données textuelles.
* Capacité à développer et à optimiser des algorithmes d'extraction des termes médicaux à partir de textes non structurés.
* Connaissance des standards de métadonnées pertinents pour le domaine des données en santé (DDI, DCAT, DataCite).
* Connaissances en technologies du web sémantique (RDF, OWL, SPARQL) et de Linked Data.
* Connaissance des principes et processus relatifs à l'interopérabilité, aux métadonnées, aux référentiels.
* Connaissance des principes de la science ouverte et des principes FAIR.
* Connaissance du domaine biomédical.
 
SAVOIR-FAIRE
* Utilisation  d'outils IA, LLM et de méthodes de fine-tuning pour l'extraction de concepts à partir de texte.
* Utilisation d'outils NLP open source tels que cTakes, Spark NLP, ou SpaCy.
* Excellent sens de l'organisation et des priorités, capacité à gérer plusieurs actions en parallèle.
* Savoir transmettre des compétences et animer des ateliers.
* Très bon niveau d'anglais oral et écrit.
 
APTITUDES
* Excellentes capacités d'analyse et de résolution de problèmes.
* Capacité à prendre des décisions et à faire preuve de discernement.
* Faire preuve d'organisation, de réactivité, de rigueur et de méthode.
* Capacité à se saisir de nouveaux sujets et de monter en compétences rapidement.
* Aptitude à communiquer efficacement des concepts techniques complexes à des publics variés.
* Travailler en autonomie et également en équipe.
 
EXPÉRIENCE(S) SOUHAITÉ(S)
* Une expérience dans l'utilisation de terminologies médicales et l'indexation de contenus de santé.
 
NIVEAU DE DIPLÔME ET FORMATION(S)
* Master 2+ ou ingénieur, en informatique médicale, ingénierie documentaire, linguistique informatique ou autre domaine pertinent.
 
POUR EN SAVOIR + :
-    Sur l'Inserm  [https://pro.inserm.fr/]
-    Sur la politique handicap : emploi.handicap@inserm.fr
-    Sur l'engagement de l'Inserm en faveur de la parité et l'égalité professionnelle [https://pro.inserm.fr/rubriques/linstitut/parite-et-egalite-professionnelle/parite-et-egalite/parite-et-egalite-professionnelle-a-l-inserm]