Bio-informaticien.ne F/H (H/F)

💼 Offre d'emploi

Type de contrat

Contrat à durée déterminée - 12 Mois

Durée de travail

35 H Travail en journée (35 H Travail en journée)

Expérience

Débutant accepté

Salaire

Mensuel de 2245,00 Euros à 2245,00 Euros

Permis demandé

Aucune information

📍 Entreprise

Description de l'offre

RESPONSABILITÉS :

Nous recherchons un.e bio-informaticien.ne d'une plateforme scienfitique pour le service mutualisé de plateformes IBSLor (Ingénierie, Biologie, Santé en Lorraine). Elle regroupe six plateformes de haut niveau technologique : Biophysique & biologie structurale, imagerie, cytométrie, protéomique, épitranscriptomique & séquençage, et génomique fonctionnelle. Ce regroupement favorise la mutualisation en mettant en commun et à disposition des structures opérationnelles de recherche, des équipements lourds structurants, et le développement de projets transversaux en apportant un soutien technologique et/ou technique.
La plateforme Epitranscriptomique & Séquençage (EpiRNA-Seq), fait partie des 6 plateformes technologiques de la SMP IBSLor. Elle a pour mission d'assurer le soutien technologique aux projets qui nécessitent ces technologies de pointe. La plateforme est équipée d'un ensemble de matériels pour l'analyse et le séquençage à haut-débit des ADN/ ARN.
Vous serez rattaché.e à la plateforme Epitranscriptomique & Séquençage (EpiRNA-Seq), spécialisée dans l'identification et la quantification des nucléotides modifiés au sein des ARN (épitranscriptomique).
Vos missions :
DÉVELOPPER DES LOGICIELS D'ANALYSE BIO-INFORMATIQUE :
· Développer des pipelines dédiés à l'analyse des données générées au sein de la plateforme, données issues du séquençage à haut-débit sur Illumina et Nanopore (Epitranscriptomique)
· Concevoir et optimiser de nouvelles méthodes d'analyse des nucléotides modifiés.
· Adapter et optimiser le fonctionnement des méthodes de travail dans l'analyse épitranscriptomique ou transcriptomique.
· Paramétrer des outils, logiciels, systèmes
· Contribuer au développement et à la maintenance des pipelines d'analyse.
TRAITER ET ANALYSER DES DONNÉES BIOLOGIQUES :
· Fournir des conseils et un soutien lors des réunions hebdomadaires de la plateforme
· Effectuer en routine une analyse primaire et secondaire (et éventuellement tertiaire) de données haut débit (NGS) (de la conception expérimentale au rapport final de l'analyse bio-informatique).
· Adapter les applications informatiques aux besoins du projet.
· Diffuser et valoriser les résultats et les développements sous forme de rapports, de publications, de présentations orales, et de formations.
· Assurer et organiser une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
CDD du 24 février 2025 au 28 février 2026.
Possibilité de télétravail.
Les candidatures sont attendues pour le 12 février au plus tard.

PROFIL RECHERCHÉ :

Vous êtes titulaire d'un diplôme de niveau Bac +2 en biologie/informatique.
Vous maitrisez les programmations dans les différents environnements informatiques (bash et R, éventuellement python).
Vous êtes en capacité d'effectuer une analyse des données biologiques en relation avec les propriétés moléculaires et cellulaires.
Vous êtes à l'aise avec l'utilisation de logiciels spécifiques à l'activité (trimmomatic, bowtie2, R-Studio).
Vous maitrisez l'anglais (niveau B1 à B2).
Vous êtes apprécié.e pour vos qualités relationnelles.
Vous savez faire preuve d'organisation, de rigueur, gérer les priorités.