Bioinformaticien.ne (IE/IR) (H/F)

💼 Offre d'emploi

Type de contrat

Contrat à durée déterminée - 18 Mois

Durée de travail

39 H Travail en journée (39 H Travail en journée)

Expérience

Débutant accepté

Salaire

Permis demandé

Aucune information

📍 Entreprise

Description de l'offre

RESPONSABILITÉS :

Laboratoire
Dans un environnement extrêmement dynamique, l'équipe d'Isabelle Janoueix-Lerosey travaille sur la biologie des cancers pédiatriques, et en particulier du Neuroblastome. L'équipe couvre différents aspects de la recherche fondamentale, de l'initiation embryonnaire du développement tumoral, aux mécanismes de progression tumorale et de métastases, en passant par l'étude de la résistance aux traitements, en intégrant également les interactions tumeur-microenvironnement.
Pour répondre à toutes nos questions complexes, nous générons et explorons une grande quantité de données « omiques » à partir de plateformes technologiques de haute qualité de l'Institut. Basés sur des technologies innovantes, nous produisons des données en bulk et à partir de cellules uniques aux niveaux transcriptomique (RNA-seq, scRNAseq, transcriptomique spatiale) ou épigénomique (ChIP-seq, ATAC-seq, scATAC-seq) ou les deux (MultiOme).

Missions
Le/La candidat.e sera chargé.e :
- d'analyser les données de séquençage épigénomiques générées par notre équipe en bulk et l'échelle de la cellule unique (ChIP-seq, ATAC-seq et scATAC-seq)
- d'intégrer ces résultats avec d'autres données omiques (RNA-seq, scRNA-seq)
- d'utiliser et/ou développer des méthodes et stratégies pour explorer les données en étroite collaboration avec les biologistes
- de suivre les avancées technologiques dans les méthodes d'analyses bio-informatiques
- de présenter lors des réunions d'équipe.

Le/La candidat.e sera supervisé.e par les chercheurs et la bio-informaticienne permanente de l'équipe. Il/elle bénéficiera d'échanges quotidiens avec les doctorants et les post-doctorants analysant eux-mêmes leurs données, ainsi qu'avec les ingénieures de notre équipe. De plus, le/la candidat.e aura l'opportunité d'interagir avec la communauté bio-informatique plus étendue de l'Institut Curie à travers le Hub Bio-informatique de l'institut.

PROFIL RECHERCHÉ :

Profil du ou de la candidate
Formation et expérience requises
- Master en bio-informatique ou dans des domaines connexes avec au moins 2 ans d'expériences
- ou Doctorat en science des données, bio-informatique ou domaines connexes.

Compétences requises
- Solides compétences dans la manipulation de jeux de données NGS.
- Solide expérience en bash et R/python (d'autres langages de programmation sont un plus).
- Expérience de travail dans un environnement Unix.
- Expérience de travail sur un cluster de calcul serait un plus.
- Bonne expérience en statistiques (tests d'hypothèses, normalisation, analyse différentielle).
- Bonne connaissance en épigénomique et/ou en biologie du cancer serait un plus.
- Très motivé.e et capable de collaborer au sein de l'équipe, avec des biologistes et des bio-informaticiens.
- Bonnes compétences en anglais écrit et oral seraient un plus (la connaissance du français n'est pas nécessaire si le candidat a un bon niveau en anglais).

Toutes nos opportunités sont ouvertes aux personnes en situation de handicap.

Informations
Type de contrat : Contrat à durée déterminée pour IE ou IR
Date de début : Février 2025
Durée : 18 mois
Temps de travail : temps plein
Rémunération : selon les grilles en vigueur
Avantages : Restauration collective, remboursement des frais de transport jusqu'à 70%, jours de RTT
Lieu du poste : Centre de Recherche Paris, Bâtiment Trouillet-Rossignol, 26 rue d'Ulm, 75005 Paris
Référence : NA
Contact
Veuillez envoyer votre CV, lettre de motivation et 2 références
Date de publication : 07/01/2025
Date limite de candidature : 15/02/2025

L'Institut Curie est un employeur inclusif et égalitaire
et applique des normes strictes en matière d'intégrité de la recherche.
https://euraxess.ec.europa.eu/sites/default/files/brochures/eur_21620_en-fr.pdf